«Микробиология почвы» С. Н. Виноградского представляет собой собрание его избранных работ. Оно состоит из десяти различных по своему объему частей. Первая часть посвящена автотрофам и содержит 5 работ о серо- и железобактериях. Во второй части имеются 3 работы, связанные с изучением морфологии бактерий. Обширная третья часть состоит из 14 исследований по нитрификации. Четвертая часть содержит 4 сообщения по анаэробной фиксации азота. В небольшой пятой части имеется только одна работа по микробной мочке льна. Микробиологическим методам исследования почвы посвящена шестая часть, которая содержит 7 работ. В седьмую часть вошли 3 сообщения по аэробному разрушению клетчатки. Большая по объему восьмая часть целиком посвящена исследованиям, связанным с изучением экологии, морфологии и физиологии азотобактера. Два сообщения по симбиотической фиксации азота составляют содержание девятой части. И, наконец, изложение основ экологической микробиологии составляет десятую и последнюю часть книги.