Под большим пальцем на корпусе Logitech MX Master 3s находятся две боковые клавиши с функцией программирования. Всего предусмотрено 7 кнопок. Среди них прорезиненное колесо прокрутки, основные, боковые клавиши, а также кнопки переключения между приложениями и смены DPI/CPI. За быстродействие и высокоточное позиционирование манипулятора отвечает светодиодный сенсор с поддержкой разрешения 8000 dpi. Показатель dpi можно изменять в зависимости от специфики выполняемых задач.
Подключается мышь двумя способами ‒ через Bluetooth и радиоканал. Во втором случае используется миниатюрный ресивер с подключением к свободному порту USB. От встроенного аккумулятора мышь будет работать до 70 дней, после чего нужно будет зарядить ее.